| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 2073038 | 8 (0.050) | 47 (0.270) +GGG |
20/268 | 5.1 | 85.3% | intergenic (‑99/‑405) | BCHEFKBB_02124/BCHEFKBB_02125 | FetA [NGO_2093]/molecular chaperone GroES [NGO_2094] |
| ? | Exported | 2073039 = | 8 (0.040) | intergenic (‑100/‑404) | BCHEFKBB_02124/BCHEFKBB_02125 | FetA [NGO_2093]/molecular chaperone GroES [NGO_2094] | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GCGGCAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑GGGGG‑‑‑GGGG‑‑‑‑T‑‑‑TGT‑GTAAAGCTGATTATCG‑TTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGG‑TTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTA > Exported/2072890‑2073166 | gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑g < 2:782507/150‑1 (MQ=255)gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑g < 1:1555666/150‑1 (MQ=255)gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGAGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATTAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGATAAGTTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑g < 2:772578/150‑1 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGTGAGCAGGCTGAGGCTGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑gg < 1:1004392/150‑1 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑ggg > 1:870718/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑ggg > 1:870721/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑ggg > 1:870794/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑‑‑GC‑‑‑gg > 2:1004024/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |