| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 2073038 | 7 (0.040) | 47 (0.230) +GGGG |
20/266 | 6.1 | 87.0% | intergenic (‑99/‑405) | BCHEFKBB_02124/BCHEFKBB_02125 | FetA [NGO_2093]/molecular chaperone GroES [NGO_2094] |
| ? | Exported | 2073039 = | 7 (0.030) | intergenic (‑100/‑404) | BCHEFKBB_02124/BCHEFKBB_02125 | FetA [NGO_2093]/molecular chaperone GroES [NGO_2094] | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GCGGCAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGG‑‑‑‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGC > Exported/2072890‑2073155 | gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑g > 1:1416522/1‑151 (MQ=255)gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg < 1:802183/150‑1 (MQ=255)gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg < 2:1465743/150‑1 (MQ=255)gcggcAAGTGGGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg < 1:802191/150‑1 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATACTTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gg > 1:531715/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gg > 1:33200/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGGATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gg > 1:1169492/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGGGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTGTTGGTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gg > 1:531698/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTAGTCCTTTTTAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAAAAATTATTTTTGTTAATATTAGCg‑‑‑‑‑gg > 1:531702/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCGGAGGCGGAAACACGGGGCGTGGATGTGTTCGTCCGGTTGAGTGGCTGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTGTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAAGTATTTTTGATTATATTCGCg‑‑‑‑‑gg > 2:8428/1‑151 (MQ=255) cAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑ggggg < 1:28014/151‑1 (MQ=255) gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCTTCCTTTTGAGTGTAGGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑tggggggg > 2:718054/1‑151 (MQ=255) gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gggggggg > 1:453742/1‑151 (MQ=255) gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gggggggg > 1:1438113/1‑151 (MQ=255) gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGAGGCGTTCATTTGTTCGTCCTGGTGAGTGTATGAAGGGCAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gggggggg > 2:1501032/1‑151 (MQ=255) gggtgAGCGAGAGCAGGGGGAGGCGGAAAAACTGGGCGTTCATTTTTTAGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAATCCAAACCGTTAAGGTTTGGAA‑TGATAAGAAAATATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTATCt‑‑‑‑‑gggggggg > 2:13118/3‑151 (MQ=255) gtgAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gggggggggg > 1:1003952/1‑149 (MQ=255) aGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTGTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAAGAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑gggggggggggtt > 1:1185008/1‑146 (MQ=255) agagCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑ggggggggggggttgtt > 1:1104494/1‑142 (MQ=255) agagCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGAg‑‑‑‑‑ggggggggggggttgtt > 1:1104054/1‑142 (MQ=255) gagCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGGTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTATCg‑‑‑‑‑ggggggggggggtggtgt > 1:1355101/1‑141 (MQ=255) agCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑ggggggggggggttgtgta > 1:509006/1‑140 (MQ=255) ggCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGGA‑GGATAAGAAAATATAATACTAATTATTTTTGGTTATCTTGGCg‑‑‑‑‑gggggggggggttgtgtaaag > 2:1403092/1‑136 (MQ=255) ggCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCg‑‑‑‑‑ggggggggggggggggggtgttg > 1:490241/1‑136 (MQ=255) ggCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGG‑‑‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGa > 1:402119/1‑151 (MQ=255) ggCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGGTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTGTATATTAGCg‑‑‑‑‑ggggggggggggttttgtgtatg > 2:928646/1‑136 (MQ=255) ggCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCATTTGAGGGTATGAAGGGAAGTTAATCCAAACCGTTAAGGTTTGGCACGGA‑AAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTATCg‑‑‑‑‑gggggggggggggtttgttaaag > 1:227203/1‑136 (MQ=255) ggAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGGTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGG‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGt > 1:66002/1‑151 (MQ=255) gTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGG‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTTAAGCGGTTTATCGGTTTTATTTGGGaa > 1:1469487/1‑151 (MQ=255) ccTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGGGGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTttg > 1:127631/1‑151 (MQ=255) ccTTTGGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGGATATATTAGCGGGTGTGGGGGGGG‑‑‑‑‑‑G‑‑‑‑TGTGTAAAGCGGATTATCGTTTTTATTTGCAAACCGTTGgttttt > 2:859407/1‑151 (MQ=255) gtgtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGGGGT‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTTCGAATCGTttttttttttttaca > 1:730676/1‑144 (MQ=255) gtATGAAGGGACGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGAGTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGTCAGGtt > 1:631849/1‑151 (MQ=255) gtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTTTTTTTTGTTGACAGGtt > 1:825770/1‑151 (MQ=255) gtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCGGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGtt > 1:825764/1‑151 (MQ=255) gtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGG‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGc > 1:621285/1‑104 (MQ=255) gtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGG‑‑‑‑‑‑GGGGGTGTGTAAAGCTGTTTATGGTTTTTATTTTCGAATCGTTGTTTTTTTTTTACAGGtt > 1:825655/1‑151 (MQ=255) gtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGAGAAGAAAAAATAATAAGAATGATTGTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGGGTTAAGCTGGTTATCGTTTTTATTTGCGGTGCGTTTTTTTttgttttcagggt > 2:425824/1‑143 (MQ=255) aGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTTTTGACAGGTTTTGTCGGAAAt > 1:689275/1‑151 (MQ=255) aaGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGGG‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGGTTATCGTTTTTATTTTCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGta > 1:1550507/1‑151 (MQ=255) aaGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TTTGTAAAGCTGATTATAGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTTTTGACAGGTTTTTTGGGAAATTtat > 1:1311908/1‑151 (MQ=255) gCCAAACCGTTAATGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATATTCATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGG‑‑‑‑‑‑GGG‑‑TGGGGTTAGCTGATTATCGTGTTTATTTGCGACGCGTTGTTGTTTGGGGTCAGGTGTGGTCGGAAAGGTTTAGTg > 2:1085199/1‑151 (MQ=255) gCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGGTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGG‑‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGATGATTTTCGTTTTTATTTGCTAATCGTTATTTTTTTTTGTAAGGTTTTGTAGGTCATGtatattg > 2:1085210/1‑148 (MQ=255) ccGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAATCGGAATATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTGTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGAtt > 1:1482418/1‑151 (MQ=255) gTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGGG‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTa > 1:175692/1‑151 (MQ=255) aGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGGGGTTTAACGTTTTTTTTTTCGAAGCGTTGTTTTTTTTTTTAAGGGTTTGTGGGAAATGTATATTGGATTTACaaa > 1:830216/1‑151 (MQ=255) aGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTTTCGGAAATGTATAGTGGATTaaaaaa > 1:502018/1‑151 (MQ=255) aGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACaaa > 1:830222/1‑151 (MQ=255) aGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCGGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTTACAGGTTTTTTCGGAAATGTATAGTGGATTAACaaa > 1:830215/1‑151 (MQ=255) ggATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGGG‑T‑‑‑‑TGTGTAAACCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTTTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATAAGGa > 2:1105944/1‑150 (MQ=255) ggATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGCAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACa > 1:1355341/1‑151 (MQ=255) taataataatTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGGGGGG‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTTCGAAGCGTTGTTTTTTGTTTACAGGTTTTGTCGGAAATGTATATTGGATTAAAAAAAATAATGACAATGCGGCGAAGc > 1:62573/1‑150 (MQ=255) | GCGGCAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCA‑GGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTAGCG‑‑‑‑‑GGGGGGGG‑‑‑‑‑‑T‑‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGC > Exported/2072890‑2073155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |