| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Exported | 999,079 | 0 | G | T | 25.8% | 360.3 / 26.2 | 178 | Y7* (TAC→TAA) | BCHEFKBB_01021 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (92/40); new base T (0/46); total (92/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.33e-19 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GGCATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGCTTGCT > Exported/998930‑999228 | ggCATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGt > 1:759953/1‑151 (MQ=255) cATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTaa > 1:1194654/1‑151 (MQ=255) cATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTaa > 1:821008/1‑151 (MQ=255) cATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTaa > 1:616671/1‑151 (MQ=255) cATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTaa > 1:1493490/1‑151 (MQ=255) cATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATAGCGGTaa > 2:739852/1‑151 (MQ=255) aTCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTaaa > 1:924085/1‑151 (MQ=255) tGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTAt > 1:820109/1‑151 (MQ=255) taaaccGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATCACCGCCTGCCGTAAACCCAAAC‑GCACCCCATCATCGTA‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGTTTAAAACC‑TAAAAAAATTAA‑GTGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGtat < 2:1155378/146‑1 (MQ=255) tCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCTTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑AAAAATCTTCTGCCTTTTTTTGGTTACAACC‑GTAAAAAATTAT‑GTGCCGCAATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGtat < 2:335061/151‑1 (MQ=255) aaCGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGtattat > 2:113582/1‑151 (MQ=255) aaCGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGtattat > 1:1486550/1‑151 (MQ=255) cgtaTTCGGTTCGCCCACCGCATTTACCGCCTGCCGAAAACCAAAAC‑GCACCTAATCATCGGT‑AAAATTCTTCTGGTTTTTTTTGTTTACAACC‑TTAAAAATTTAA‑GTGCCGCATTTGCTTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 1:904521/148‑1 (MQ=255) cgtaTTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGTT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 2:598278/148‑1 (MQ=255) cgtaTTCCGTTCGCGCACCGCAATTACCGCCTGCCGTAAAGCAAAAC‑GCACCGCATCATCGTT‑CAAAATCTTCGGCCGTTTATTGTTTACACCC‑GTAAAAAAGTAA‑GTCCCGCCATTGCGTTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 2:553106/148‑1 (MQ=255) cggtttcggTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGA‑AAAAATCTTCTGCCGTTTTTTGGTTACAACC‑GTAAAAAATTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 2:394088/143‑1 (MQ=255) cGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCG‑AAAACCAAACCGCACCGATTCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGATACAACC‑TAAAAAAAGTAA‑GTGCCGCATTTGCGGTAACA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 2:348650/151‑1 (MQ=255) cGGATTCCGTTCGCCCACCGCAATTACCGCCTGCCGAAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑AAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTAACAACC‑TTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 2:459806/151‑1 (MQ=255) cGGATTCCGTGCGCGCACCGCATTTACCGCCTGCCGAAAACCCAACC‑GCACCGCATCAGGGTT‑CAAAATCTTCGGCCTTTTTTTGGTTACAACC‑GTAAAAAATTAA‑GGGCCCCAATTGCGTTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 1:308822/151‑1 (MQ=255) cGGATGCCGTTCGCGCCCCGCCATTACCGCGTGCCTTAAAGCCAAAG‑GCACCGCACCTTCGGT‑CAAACTAGTCGGCCTTTTTTTGGTTACACCG‑GTAAAAATTTAA‑GTGCGGCCTTTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc < 2:851091/151‑1 (MQ=255) ttttCCGTTCGCGCACCGCCATAACCGCCTGCCTTAAAGCAAAAC‑GCACCGAAT‑ATTGGTTAAAAATCTTCTGCCTTTTTTTGGTTAAAACC‑TTAAAAAATTAT‑GTGCCGCCTTTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTc < 1:672155/149‑1 (MQ=255) gATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGc > 1:1429384/1‑149 (MQ=255) aTTCGGTTCGCGCCCCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCACAC‑GCCCCGCATCATCGGT‑AAAAATCTTCTGCCTTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTc < 2:1396689/150‑1 (MQ=255) aTTCCGTTCGCGCCCCGCCATTCCCGCCTGCCTTAAAGCAAACC‑GCACCGAATCATCGTT‑AAAAATCTTCTGCCTTTTATTGGTTACAACC‑TTAAAAAATTAT‑GTGCCGCCTTTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTc < 1:726520/150‑1 (MQ=255) cgcACCGCCATTACCGCCTCCCTTAAAGCCAAAC‑GCACCGAATCATCGTT‑AAAAATCTTCTGCCGTTTTTTGGTTACAACC‑TAAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGAttt < 1:1537063/150‑1 (MQ=255) cgcACCGCCATTACCGCCTCCCGTAAACCCAACC‑CCACCGAATCATCGGT‑CAAAATCTACTGCCTTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATGGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGAttt < 2:777251/150‑1 (MQ=255) ccGCCATTTCCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCTGTTATTGGTTACAACC‑GGAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 2:202308/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTTTTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 1:615746/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCTGAATGATTTTGTat > 2:378254/1‑150 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 1:691786/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 1:365056/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 1:1226766/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 1:698917/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCAATTGCGGTAAAA‑ACGACTGAATATCAGAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg > 2:202307/1‑151 (MQ=255) ccGCCATTACCGCCTGCCGAAAAGCCAAAC‑GCACCTCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑TTAAAAAATTAA‑GTGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAg < 2:859693/151‑1 (MQ=255) ccATTCCCGCCGGCCTTAAAGCCACAC‑GCACCCAATCATGGTT‑AAAAATCTTCGGCC‑TTTTTTGGGTAAAACCCTTAAAAACTTAT‑GTGCCGCCTTTGGGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGc < 1:1214115/150‑1 (MQ=255) ccATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAACC‑GCACCGAATCATCGTT‑CAAAATCTTCTGCCTTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCCCCATTGCGGTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGcc < 2:30332/151‑1 (MQ=255) ccATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTGTTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGc > 1:1324347/1‑150 (MQ=255) ccATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGc > 1:900312/1‑150 (MQ=255) ccATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑ACACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGc > 2:479864/1‑150 (MQ=255) ccATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑ACACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGc > 2:479889/1‑150 (MQ=255) ccATTACCGCCTGCCGTAAAACCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGc > 1:347533/1‑150 (MQ=255) gCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACAtt > 2:1594442/1‑151 (MQ=255) gCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACAtt > 1:1310370/1‑151 (MQ=255) gCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACAtt > 1:874843/1‑151 (MQ=255) cgcacctaatcatcGGT‑CAAACTCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTCCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGAc < 2:920418/143‑1 (MQ=255) cACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACAt > 1:576449/1‑151 (MQ=255) ccGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGACTGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATtg > 2:1292063/1‑151 (MQ=255) ccGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATtg > 1:692944/1‑151 (MQ=255) ccGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATtg > 1:1088545/1‑151 (MQ=255) ccGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTATATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATtg > 1:1035397/1‑151 (MQ=255) ccGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTATATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATtg > 1:1035408/1‑151 (MQ=255) cGGT‑AAAAATCTTCTGCCGTTTTTTGGTTACAACC‑TTAAAAATTTAA‑GTGCCGCAATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATgg < 2:1596438/151‑1 (MQ=255) ggT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGa > 1:186105/1‑151 (MQ=255) gT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGAt > 1:930294/1‑151 (MQ=255) attcttctGCCTTTTATTGGTTACAACC‑TTAAAAATGTAT‑GTGCCGCAATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCaa < 1:1450985/149‑1 (MQ=255) aaactccggCCGATTATCGGTTACAAAC‑TTAAAAATGTAA‑GCGCCGCCATTGCGGTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTAGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCaa < 2:1326541/143‑1 (MQ=255) cttctGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAatga < 2:210802/151‑1 (MQ=255) cttctGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGAAGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAAGGGATTGCAatga > 1:1265597/1‑151 (MQ=255) tctGCCTTTTTTTGTTTACAACC‑TTAAAAAATTAA‑GTGCCGCAATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAatgatg < 1:50296/151‑1 (MQ=255) tctGCCGTTTTTGGGTTACAACC‑‑TAAAAAAATAAAGTCCCCCCCTGCCGTTAAAA‑ACGACGGTAATTCATAGTATAATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAatgatg < 1:50300/151‑1 (MQ=255) cGTTTATTGGTTAAAACC‑GTAAAAATGTAA‑GTGCCGCCTTTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAAt < 2:18880/151‑1 (MQ=255) tttttgggTTACAACC‑GTAAAAATGTAT‑GTGCCGCCTTTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATg < 2:347413/144‑1 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCGTAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:773966/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCCTAGTATTATGCTCGGAATGAGTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACCTTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTCAAgg > 2:1520161/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGACTGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:801984/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 1:1667663/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 1:974260/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 1:134424/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:107902/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:1445626/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:1142137/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:1278479/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:774019/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 2:1171789/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAAGGTTAAAgg > 2:1044875/1‑151 (MQ=255) ggTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTCCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAgg > 1:119509/1‑151 (MQ=255) tttACAACT‑TTAAAAATTTAA‑GTGCCGCCATTGGTTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGt < 1:257389/150‑1 (MQ=38) ttACACCC‑TTAAAAAAGTAA‑GTCCCGCCATCGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGt < 2:1510232/150‑1 (MQ=38) ttACAACC‑GTAAAAAATTAA‑GTGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTACTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGt < 2:759713/150‑1 (MQ=255) aattaa‑gtGCCGCCTTTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAg < 1:774210/148‑1 (MQ=255) aattaa‑gtGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAg < 1:774263/148‑1 (MQ=255) aagtat‑gtGCCGCCATTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAg < 1:401262/151‑1 (MQ=255) aagtaa‑gtGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAg > 1:1528395/1‑151 (MQ=255) agtaa‑gtGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGt > 1:15546/1‑151 (MQ=255) tGCCGCCTTTGCGGAAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATcc < 1:117545/149‑1 (MQ=255) ccgccTTTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGcc < 1:223241/151‑1 (MQ=255) ccgccTTTGCGGAAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGcc < 2:1622517/151‑1 (MQ=255) ccgccATTGCGTTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGcc < 2:692734/151‑1 (MQ=255) cccccATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGcc < 2:1215002/148‑1 (MQ=255) ccgccatggggTAAAACACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGc < 1:1073199/141‑1 (MQ=37) tttGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 1:1594998/150‑1 (MQ=255) tttGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAACGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 2:1420067/150‑1 (MQ=255) tttGCGGTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 1:1595039/150‑1 (MQ=255) tttGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 2:1486035/150‑1 (MQ=255) aTTGCGTTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 2:1246166/151‑1 (MQ=255) aTTGCGTTAAAA‑AAGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGTATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 2:1229073/151‑1 (MQ=255) aTTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGc < 2:616479/151‑1 (MQ=255) cGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGCTTg > 1:43287/1‑150 (MQ=255) gTAAAC‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGCTTGCt < 1:331017/150‑1 (MQ=255) | GGCATCAACACCCATGCCAAAATTTCAAACGGATTCCGTTCGCGCACCGCCATTACCGCCTGCCGTAAAGCCAAAC‑GCACCGCATCATCGGT‑CAAAATCTTCTGCCGTTTATTGGTTACAACC‑GTAAAAAAGTAA‑GTGCCGCCATTGCGGTAAAA‑ACGACGGTATTTCATAGTATTATGCTCGGAATGATTTTGTAGGCCGGATTCTTGAATTCGACATTTTGGACATTGCTGCAATGGATTGCAATGATGGGAATGTTAAAGGTTTTGTCGGATACAAGTATCCGGCCTACGCTTGCT > Exported/998930‑999228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |