| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | Exported | 1,396,211 | 0 | C | G | 31.0% | 172.1 / 27.9 | 87 | A93G (GCG→GGG) | BCHEFKBB_01437 | ABC transporter permease [NGO_1433] |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TGTTCGGCGAGTTTATGCTGCCTGCGCCGGTAGAGGTGTTTCAAAAATCTTTGGATTTATTGAAACATTTTCAGGAAAATGAAATCGGGATTTCGCTGTGGCGGTCGGTAGTGGGTATTTCGGTTGCTTTG‑ATAGCAGGATTGGCGGCGGGGCTGGTGGCGGGGCTGGTGGCGGGCAGTTTTAAGACGGCGATGGCGTTGCTTAAGCCTGTGATTACGATTTTGTTAGCAATGCCGCCGATTATTTGGGTGGTGATGGCGTTGTTTTGGTTCGGGTTCGGCAATCCGAGCGTGTTG > Exported/1396064‑1396359 | tgtTCGGCGAGTTTATGCTGCCTGCGCCGGTAGAGGTGTTTCAAAAATCTTTGGATTTATTGATACATTTTCAGGAAAATGAAATCGGGATGTCGCTGTGGCGGTCGGTAGTGGGTATGTCGGTTGCTTTG‑ATAGCAGGATTGGCggcggg > 2:197633/1‑151 (MQ=255)tgtTCGGCGAGTTTATGCTGCCTGCGCCGGTAGAGGTGTTTCAAAAATCTTTGGATTTATTGAAACATTTTCAGGAAAATGAAATCGGGATTTCGCTGTGGCGGTCGGTAGTGGGTATTTCGGTTGCTTTG‑ATAGCAGGATTGGCggcggg > 1:762111/1‑151 (MQ=255) ttCGGCGAGTTTATGCTGCCTGCGCCGGTAGAGGTGTTTCAAAAATCTTTGGATTTATTGAAACATTTTCAGGAAAATGAAATCGGGATTTCGCTGTGGCGGTCGGTAGTGGGTATTTCGGTTGCTTTG‑ATAGCAGGATTGGCgggggggc < 1:1257790/151‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |