| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 2073038 | 10 (0.050) | 42 (0.210) +GGG |
17/270 | 7.0 | 79.8% | intergenic (‑99/‑405) | BCHEFKBB_02124/BCHEFKBB_02125 | FetA [NGO_2093]/molecular chaperone GroES [NGO_2094] |
| ? | Exported | 2073039 = | 11 (0.050) | intergenic (‑100/‑404) | BCHEFKBB_02124/BCHEFKBB_02125 | FetA [NGO_2093]/molecular chaperone GroES [NGO_2094] | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GGCGGCAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGG‑‑‑T‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTACAGATAGTACGGA > Exported/2072889‑2073179 | ggcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTGGAGTGTATGAAGGGAAGTTAATCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg > 2:915932/1‑151 (MQ=255) gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg < 2:778432/150‑1 (MQ=255) gcggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGGGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAGTAATAATTATTTTTGGGTAGATTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g > 2:979700/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCTGGCTGAGGCGGAAAACCGGGGCGTTCATGTGTTCGTGCTATTGAGTGGAGGAAGGGCAGTTAAGCCAAACCGTTCAGGTTGGGCTGGAGAAGAAAAAATAAGAAGAGTTATGTTGGTTGATAGTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g‑‑‑g > 2:1651084/1‑151 (MQ=255) cggcAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g‑‑‑g > 1:370325/1‑151 (MQ=255) aaGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g‑‑‑gg‑‑‑ggg > 1:1209283/1‑151 (MQ=255) gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑T‑‑Cg‑‑g‑‑‑gg‑‑‑ggggg > 2:1504967/1‑151 (MQ=255) gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g‑‑‑gg‑‑‑ggggg > 1:1136042/1‑151 (MQ=255) 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cATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TTTGTAAAGCTGATTAACTTTTTTATTTGCGAAGCg > 1:447339/1‑151 (MQ=255) cATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTTCGAAGCg > 1:447317/1‑151 (MQ=255) cATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCg > 1:1269402/1‑151 (MQ=255) cATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCg > 1:447351/1‑151 (MQ=255) cATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCg > 1:391885/1‑151 (MQ=255) 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gtgtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAATCTGATTATCGTTTTTATTTGAGAAGCGTTTTTTTttgtttaaaggt > 1:825439/1‑144 (MQ=255) gtATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTGTGGCAGGCTAAGAAAAAATATTAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGG‑‑T‑‑‑TGGGGAAAGCTGATTTTCGGTTTTATTTGCGATGCGTGGTTGTGTGTTGTCAGGTTTTg > 2:1366829/1‑151 (MQ=255) gctgcaGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTGTGGGTTGGCAGGATCAGAAAAAATAATAGGTATTAGTGTTGTGTATGGTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTCAATCTGTTGATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTtggtttggaggtttg > 2:1553019/6‑141 (MQ=255) aaGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGTCAGGTTTTGTCGGAAATGtata > 1:592776/1‑151 (MQ=255) gCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTTTCGTTTTTATTTGAGATGCGTTGTTTTTTGTTGAAAGGTTTTTTGGGAAATGtatatt > 2:558668/1‑149 (MQ=255) 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aaaTAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGG‑T‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAg > 1:1659976/1‑150 (MQ=255) taataatTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGATTTTTAAGGTTTTTATTTGCGAAGCGTTTTTTTTTGTTGACAGGTTTTTTCGGAAATGTATATTGGATTAACAAAAATAAGGTGATGGCGGGGAAGCCggag > 2:1420812/1‑148 (MQ=255) ttattTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAATGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTa > 1:87032/1‑151 (MQ=38) ttattTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGGGGGT‑‑‑TGTGTAAACCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTTTTTTTTTTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTa > 1:87001/1‑151 (MQ=37) atatTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGG‑‑‑GGG‑TGTGTAAAGGTGATTATCGTTTTTATTTGCGAATCGTTGTTTTTTTTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAAAAAAAATATGGACAAGGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTACAGATAGTAAGGa > 2:1142543/1‑151 (MQ=25) | GGCGGCAAGTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGG‑‑‑T‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTACAGATAGTACGGA > Exported/2072889‑2073179 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |