| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (9/0); new base G (29/0); total (38/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTGTGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑CG‑‑G‑‑‑GG‑‑‑GGGGG‑‑‑T‑‑‑TGTGTAAAGCTGATTATCGTTTTTATTTGCGAAGCGTTGTTTTTTGTTGACAGGTTTTGTCGGAAATGTATAGTGGATTAACAAAAATCAGGACAAGGCGGCGAAGCCGCAGGCAGTACAGATAGTACGGAACCGATTCACTTGGTG > Exported/2072897‑2073195 | gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑T‑‑Cg‑‑g‑‑‑gg‑‑‑ggggg > 2:1504967/1‑151 (MQ=255)gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g‑‑‑gg‑‑‑ggggg > 1:1136042/1‑151 (MQ=255)gtgtGAGCGAGAGCAGGCTGAGGCGGAAAAACGGGGCGTTCATTTGTTCGTCCTTTTGAGTGTATGAAGGGAAGTTAAGCCAAACCGTTAAGGTTTGGCAGGATAAGAAAAAATAATAATAATTATTTTTGTTTATATTA‑‑‑G‑‑Cg‑‑g‑‑‑gg‑‑‑ggggg > 1:94521/1‑151 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |