| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Exported | = 2017675 | 136 (1.040) | coding (282/483 nt) | BCHEFKBB_02068 | fimbrial protein [NGO_10995] | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
CTGAACATATTTGCCTTTGATTGTTGAAGCGGATGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCTTTGCCGGCGGCGTCGGCGTTGGCTTCGGTGCGCTTAACCGGCTGTCCGCAGAACCATTTTACCGAACCGGCTTCACGCTTGGCCCACAGGGAGAGTC > Exported/2015447‑2015743 | cTGAACATATTTGCCTTTGATTGTTGAAGCGGATGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTc < 1:98284/151‑1 (MQ=255)cTGAACATATTTGCCTTTGATTGTTGAAGCGGATGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTc < 1:498448/151‑1 (MQ=255)cTGAACATATTTGCCTTTGATTGTTGAAGCGGATGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTc < 1:601848/151‑1 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(MQ=255) | CTGAACATATTTGCCTTTGATTGTTGAAGCGGATGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCTTTGCCGGCGGCGTCGGCGTTGGCTTCGGTGCGCTTAACCGGCTGTCCGCAGAACCATTTTACCGAACCGGCTTCACGCTTGGCCCACAGGGAGAGTC > Exported/2015447‑2015743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |