| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 2015238 | 332 (2.000) | 13 (0.100) | 12/230 | 5.5 | 5.2% | coding (248/681 nt) | BCHEFKBB_02064 | large pilS cassette protein [NGO_10975] |
| ? | Exported | 2015627 = | 213 (1.630) | coding (313/363 nt) | BCHEFKBB_02065 | hypothetical protein [NGO_10980] | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
TGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCTTTGCCGGCGGCGTCGGCGTTGGCTTCGGTGCGCTTAACCGGCTGTCCGCAGAACCATTTTACCGAACCGGCTTCACGCTTGGCCCACAGGGAGAGTCTTTTGCCTTGGATTTCTTTGTTTACGCCGCTT > Exported/2015480‑2015775 | tGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTTCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGAt > 1:1227110/1‑151 (MQ=255) ccACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATg < 1:251553/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCGGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGt > 2:1337916/1‑151 (MQ=255) cGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGt < 1:575247/151‑1 (MQ=255) cGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGt > 2:532453/1‑151 (MQ=255) cGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAAAATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAAATTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGt > 1:104942/1‑151 (MQ=255) cGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTAAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTATCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGt > 1:1260442/1‑151 (MQ=255) cGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTtgg > 2:132107/1‑151 (MQ=255) 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ccGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTc < 2:247137/150‑1 (MQ=255) ccGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTc < 2:247113/150‑1 (MQ=255) ccGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCt < 2:701497/151‑1 (MQ=255) ccGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCt < 1:672295/151‑1 (MQ=255) ccGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCt < 1:1310769/151‑1 (MQ=255) 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TGCCACGCCGGCAGAGCCGTTGTCTTTGGGCCATTCGCCGTTTTCAGGTAATATTCGGTGAGGGCTGATTTATTTAAAATTTAAGGCCTAATTTGCCTTAGCTAGCAGAGAACGGGTCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTTGATGCCGTTGGTGGTGTCTTTGCCGGCGGCGTCGGCGTTGGCTTCGGTGCGCTTAACCGGCTGTCCGCAGAACCATTTTACCGAACCGGCTTCACGCTTGGCCCACAGGGAGAGTCTTTTGCCTTGGATTTCTTTGTTTACGCCGCTT > Exported/2015480‑2015775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |