| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Exported | = 2017675 | 136 (1.040) | coding (282/483 nt) | BCHEFKBB_02068 | fimbrial protein [NGO_10995] | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GCCTTTGATGTCGGAGGGGGGGATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACGGCAGGTGCTTGGTGTCGATTTTGCCTTTGCCGCCGTTGTCGGTGCCGGCGTCGTCGGTAACGTCGTCGTTGGCGGCGTCGTTGCGCTTAACCGGCTGTCCGCAGAACCATTTTACCGAACCGGCTTCACGC > Exported/2017526‑2017822 | gCCTTTGATGTCGGAGGGGGGGATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTAt > 1:127998/1‑151 (MQ=255) cTTTGATGTCGGAGGGGGGGATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATcg < 1:142526/151‑1 (MQ=255) ttGATGTCGGAGGGGGGGATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATcgcg > 2:936355/1‑151 (MQ=255) aTGTCGGAGGGGGGGATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCa > 1:1024251/1‑151 (MQ=255) gggggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACg > 2:1257665/1‑151 (MQ=255) gggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACgg > 1:1322205/1‑150 (MQ=255) gggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACgg < 1:1257988/150‑1 (MQ=255) gggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACgg > 1:741340/1‑150 (MQ=255) gggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACgg > 1:1101197/1‑150 (MQ=255) ggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACGGc < 1:985726/150‑1 (MQ=40) ggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACGGc < 1:985733/150‑1 (MQ=40) ggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACGGc < 1:1234036/150‑1 (MQ=40) ggggATGCCACGCCGGCAGAAGTGTTGTCTTCCGGCCATTTGCCGTGATTCGGGTAATACCCGGCAACGGCTGATTTTTTGGAAGTGTTTGAAATCGGCGCGTGGTGTTTC‑GTGCAAACGGCAGTTGATTTATCGCGGCAGGTTGACGGc < 1:1234048/150‑1 (MQ=40) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |