| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Exported | 1,891,025 | 0 | A | T | 32.8% | 192.1 / 23.9 | 116 | L75Q (CTG→CAG) | BCHEFKBB_01932 | pilus assembly protein [NGO_10270] |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (59/19); new base T (1/37); total (60/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.96e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CTGCTGGGGGCGAAGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTGGCGCTGATGA > Exported/1890875‑1891173 | ctgctgGGGGCGAAGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCa > 1:456263/1‑151 (MQ=255)ctgctgGGGGCGAAGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCa > 1:1368336/1‑151 (MQ=255) gggCGAAGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCaggtaggt > 1:240441/1‑151 (MQ=255) cGAAGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTcg < 1:768275/150‑1 (MQ=255) aaGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTcgccg > 2:297817/1‑151 (MQ=255) tagtTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCgccgcc > 1:162807/1‑150 (MQ=255) gttgtGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCAGGGCGTGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCATGCCGTAGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCGaaa > 1:1219144/1‑151 (MQ=255) ttgtGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGaaa < 2:124141/150‑1 (MQ=255) tttaatttttCGTCGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGGGGGTCGTACTAATCCAATCACCGGCTGTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGTTAACAAACCCGC‑AACCCTTGCCGTTGGGGGGCTGTTTGGTCGCCGCCCCAAAAACGACGATAc < 1:524738/145‑1 (MQ=255) ttaatttttCGTTGCTGTAGCCTACCAACCCGGGGCGGGTCTTAATAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCTTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACATTGCCGTTGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATAc < 2:684166/145‑1 (MQ=255) ttCGTAGCTGTAGCCTCCCACCCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCTTTTCAGACTATCGGTAT‑AAAACCGGGAAACCTTGCCGTCGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCtttt < 2:401479/151‑1 (MQ=255) gCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGca > 1:309722/1‑151 (MQ=255) gCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGca > 2:1222902/1‑151 (MQ=255) gCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGca > 2:1371018/1‑151 (MQ=255) ccTACCAACCCCGGGCGGGTCTTACTAATCAACTCACGGGCTTTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGTTAACAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTTGGGCGGCTGTTTGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACg < 2:552299/150‑1 (MQ=255) ccTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCACCGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGTTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGGGGCAGTTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACg < 2:377797/150‑1 (MQ=255) tACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTa > 1:859801/1‑151 (MQ=255) tACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTa > 2:1081357/1‑151 (MQ=255) tACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTa > 2:1178977/1‑151 (MQ=255) aCCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTAt > 1:1156894/1‑151 (MQ=255) aCCCCGGGGGGGTCGTACTAAGCCCAGCCACGGCTTGGCC‑GCGCCCTTTCAGCCTTTCGGTATCAAAACCGG‑AACCCTTGCCGTTGGGGGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGACAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGt < 2:22968/151‑1 (MQ=255) ccccGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGta > 2:424601/1‑151 (MQ=255) ccccGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGta > 2:424600/1‑151 (MQ=255) ccccGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGta > 2:323159/1‑151 (MQ=255) ccccGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGta > 1:371393/1‑151 (MQ=255) ccccGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGta > 1:207859/1‑151 (MQ=255) ggcgggTCGTACTACTCCAATCACCGGCCTGGCC‑GCGCCCTTACCGACTATCGTTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCTAAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGtattat < 2:723294/150‑1 (MQ=255) ggcgggTCGTACTAATCCAATCACGGGCAGGGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGTAATCAAACCCGT‑AAACCGTGCCGTAGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGtattat < 1:529326/150‑1 (MQ=255) ggggTCGTAATAATCCAATCACCGGAATGGCC‑GCGCCTTTACACACTATCGTTAAAAAAACCGT‑AAACCTTGCCGTTGGGCGGCTGGTTGTTCGCCGCCCAGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCg < 1:685496/149‑1 (MQ=255) cgggTCTTAATAATCCAATCAACGGCTTGGCC‑GCGCCCTTACACACTATCGGTAACAAACCCGT‑AAACCTGGCCGTCGGGGGGCTGGTTGGTCGCCCCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCg < 1:685492/150‑1 (MQ=255) cgggTCGTACTAATCCAATCAACGGCATGGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTGCCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCg < 2:911062/150‑1 (MQ=255) cgggTCGTAATAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTGGCCGTAGGGCGGCAGTTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCg < 2:1156577/150‑1 (MQ=255) ggTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAAt > 1:396526/1‑151 (MQ=255) ggTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCGTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAAt > 2:755610/1‑151 (MQ=255) gTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATg > 2:663862/1‑151 (MQ=255) gTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCTAATGaga > 1:453150/1‑149 (MQ=255) gTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGata > 1:971170/1‑151 (MQ=255) gTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGata > 2:1136977/1‑151 (MQ=255) gTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGata > 2:354202/1‑151 (MQ=255) gTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGata > 2:757941/1‑151 (MQ=255) gTACTAATCCAATCAACGGCATAGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGACAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGaaagaaa > 2:757950/1‑146 (MQ=255) tACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCATACTATCGGTATCAAAACCGT‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGTTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGatat < 2:299843/151‑1 (MQ=255) aaTCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGtt > 1:287921/1‑151 (MQ=255) caccAATCACCGGATTTGCC‑GCGCCCTTTCCGACTAGCGGTATCAAAACCGT‑AACCCTTGCCGTGGGGCGGCAGTTAGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:1320245/149‑1 (MQ=255) atccaaacacgggCAGTGCC‑GCGCCTTTTCAGACTATCGGAATCAAACCCGG‑AACCCGTGCCGTCGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCTAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:600201/140‑1 (MQ=255) atcaaatcacgggCATTGCC‑GCGCCCTTTCCTACTACGGGTAACAAACCCGT‑AAACCTTGCCGTCGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:1207149/140‑1 (MQ=255) atcaaaacaccGGCTTTGCC‑GCGCCATTTCATACTATCGTTAACAACCCCGT‑AAACCTTGCCGTTGGGGGGCTGTTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGAAGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:855787/141‑1 (MQ=255) atcaaaTCACCGGCTTGGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATAAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTTGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:1159731/147‑1 (MQ=255) atcaaaTCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTACAGACTATCGTTATAAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTCGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 2:773244/147‑1 (MQ=255) atcaaaTCAACGGCATGGCC‑GCGCCCTTTAAGACTATCGTTATCAAAACCGT‑AAACCTCGCCGTTGGGGGGCTGTTTGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:133138/147‑1 (MQ=255) acccAATCAAGGGC‑TTGCCCGCGCCCTTTCTCACTATCGTTATCAAAACCGG‑AACCCTTGCGGTTGGGCGGCAGTTTGGTCGCCGCCCCTAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 1:1295912/149‑1 (MQ=255) aacaaaTCACCGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGTTAACAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTTGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 2:1204537/147‑1 (MQ=255) aTCCAATCACCGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTACCAAAACCGG‑AACCCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 2:1261974/151‑1 (MQ=255) aTCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCATACTATCGTTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTTGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 2:211246/151‑1 (MQ=255) aTCCAATCAACGGAATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTCGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTtg < 2:328838/151‑1 (MQ=255) aTCAACGGCTTTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AACCCTTGCCGTTGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGttt < 2:753699/151‑1 (MQ=255) aTCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGT‑AAACCTTGCCGTTGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGttt < 1:374950/151‑1 (MQ=255) aTCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTATCAGACTATCGGAATCAAAACCGC‑AAACCTTGCCGTTGGGGGGCTGGTCGGTCGCCGCCCCCAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGttt < 1:738526/151‑1 (MQ=255) cGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTgtctt > 1:416406/1‑149 (MQ=255) cGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGGGTttctt > 1:992563/1‑149 (MQ=255) gCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGa > 2:1143770/1‑151 (MQ=255) gCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGACTGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTa > 2:82807/1‑151 (MQ=255) cgcCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAat > 2:1136425/1‑151 (MQ=255) cccTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAatta > 2:310887/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTCTCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 2:400070/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 2:940574/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 1:1145665/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 1:1229204/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 1:1248669/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 1:1354203/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 1:57835/1‑151 (MQ=255) cTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAattatt > 1:432393/1‑151 (MQ=255) gACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATg > 1:1092607/1‑151 (MQ=255) aCTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTAt < 2:1340428/149‑1 (MQ=255) aTCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTa > 2:1310790/1‑151 (MQ=255) aTCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTa > 2:1110949/1‑151 (MQ=255) ttataaaaaCCGT‑AAACCTGGCGGTTGGGCGGCTGTTTGGTCGCCGCCCCTAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAAtt < 1:901534/146‑1 (MQ=255) ttaaaaaaaCCGG‑AAACCTTGCGGTTGGGGGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAAtt < 1:1366946/146‑1 (MQ=255) gTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAAt < 2:1112489/150‑1 (MQ=255) tATCAAAACCGT‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTAAGGGTAAAtt < 1:817485/150‑1 (MQ=255) aTCAACACCGT‑AACCCTTGCGGTAGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTgg < 2:57822/151‑1 (MQ=255) aTCAAAACCGT‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTgg < 2:8648/151‑1 (MQ=255) aaaaCCGT‑AAACCTTGCGGTTGGGCGGCAGGTTGGTGGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTATAATTATTTGTATGGGTAAATTGgcgc < 2:805123/151‑1 (MQ=255) aaacccgcaaaCCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTTGGTCGCCGCCCCGAACACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGCTATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAAGTATTTGTATGGGTAAATTGgcgc < 2:805124/143‑1 (MQ=255) ccGG‑AAACGTTGCCGTTGGGCGGCTGGTAGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTccc < 1:37879/151‑1 (MQ=255) ccGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTcc > 2:818846/1‑150 (MQ=255) ccGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTcc > 2:818876/1‑150 (MQ=255) ccgtaaaCCTTGCCGTTGGGGGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTccc < 1:664042/147‑1 (MQ=255) ccgtaaaCCTTGCCGTTGGGCGGCTGTTAGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTccc < 1:288483/147‑1 (MQ=255) aaaCGTTGCCGTTGGGCGGCTGTTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTc < 2:1248330/151‑1 (MQ=255) aaaCCTTGCCTTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTACCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTc < 2:131379/151‑1 (MQ=255) aaaCCTTGCCGTTGGGCGGCAGGTTGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTc < 2:900169/151‑1 (MQ=255) aaaCCTTGCCGTAGGGCGGCTGGTTGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTc < 2:240369/151‑1 (MQ=255) aCCTTGCCTTTGGGCGGCTGTTTGGTCGCCGCCCCTAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCtt < 1:552124/151‑1 (MQ=255) ccTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCGTTTTGAGCAACAACGGTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCAGTCttt > 2:314785/1‑151 (MQ=255) ccGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTg > 1:1008993/1‑151 (MQ=255) gggCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTGgcg > 1:479221/1‑149 (MQ=255) ggcggcAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTGgcg > 2:287945/1‑148 (MQ=255) gcggcAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTGGCGCtga > 2:862574/1‑151 (MQ=255) gcAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAAGGATATAGTTGTGGTGCTGCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTCAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTGGCGCtgaggg > 1:728170/1‑148 (MQ=255) | CTGCTGGGGGCGAAGTAGTTGTTGTGGCATGTGACATTTTCGTAGCTGTAGCCTACCAACCCCGGGCGGGTCGTACTAATCCAATCAACGGCATTGCC‑GCGCCCTTTCAGACTATCGGTATCAAAACCGG‑AAACCTTGCCGTAGGGCGGCAGGTAGGTCGCCGCCCCGAAAACGACGATACCGCCTTTTTGAGCAACAACGTTATCGGTATTATCGAATGATATAGTTGTGTTTCTTCTGATTTTAAAATTATTTGTATGGGTAAATTGGCGCTCCCTGTCTTTTTTTGGCGCTGATGA > Exported/1890875‑1891173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |